Bioinformática
Aplicação de técnicas computacionais à análise de dados biológicos, genômicos e metagenômicos.
Universidade Federal Rural da Amazônia (UFRA) — Campus Paragominas
LabCompAp
Laboratório de Computação Aplicada
Pesquisa computacional aplicada à Amazônia
Sobre
Laboratório de Computação Aplicada
O Laboratório de Computação Aplicada (LabCompAp) é o espaço físico destinado às atividades computacionais do Núcleo de Pesquisas em Computação Aplicada (NPCA), da Universidade Federal Rural da Amazônia (UFRA), no campus Paragominas.
O laboratório apoia o desenvolvimento de pesquisas em inteligência computacional, biologia computacional, bioinformática e informática agrária.
- Instituição
- Universidade Federal Rural da Amazônia (UFRA)
- Campus
- Campus Paragominas
- Criação
- 26 de julho de 2024
Áreas de atuação
Três áreas concentram as linhas de pesquisa do laboratório.
Inteligência Computacional
Modelos de inteligência artificial e aprendizado de máquina para problemas complexos.
Biologia Computacional
Modelagem e simulação de sistemas biológicos com ferramentas computacionais.
Técnicas e competências
Técnicas e metodologias utilizadas no desenvolvimento das pesquisas.
- IA / Machine Learning
- Ciência de Dados
- Bioinformática
Deep LearningData SciencePrevisão de Séries TemporaisRedes Neurais ArtificiaisComputer Vision and Deep LearningAnálise bioinformática de dados NGSMachine LearningAnálise de DadosAnálise MetagenômicaAnálise GenômicaAnálise de TranscriptomasTreinamento de algoritmos de visão computacionalData WarehouseLLMs (Large Language Models)Bioinformática e MultiômicaData MiningIA GenerativaAnálise de Big DataTransfer LearningAnálises Ômicas
Equipamentos e infraestrutura
Equipamentos e recursos disponíveis no laboratório. 23 itens no catálogo.
| Equipamento | Quantidade | Configuração principal |
|---|---|---|
| Noturno — servidor de alto desempenho | 1 | HPE · ML350 2 × Intel Xeon Silver 4210R; 128 GB RAM; 4 × 4 TB HDD em RAID 5. |
Especificações técnicas
| ||
| Xavier — servidor de alto desempenho | 1 | UPD SYS-620P-TR 2 × Intel Xeon Silver 4310; 256 GB RAM ECC; 2 × 14 TB HDD. |
Especificações técnicas
| ||
| Ciclope — Apple iMac | 1 | Apple · iMac M3 Apple M3; 24 GB de memória unificada; SSD de 2 TB. |
Especificações técnicas
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| Magneto — servidor de alto desempenho | 1 | 2 × Intel Xeon Gold 5520+; 768 GB RAM; 2 × NVIDIA RTX 6000 Ada de 48 GB. |
Especificações técnicas
| ||
| Fênix — drone multisensor | 1 | Spectral 2 Nuvem UAV Sensores RGB para mapeamento, multiespectral e termal. |
| No-break SMS Net4 | 2 | SMS · Net4 1800VA Potência de 1800 VA. |
| No-break SMS Power Sinus | 2 | SMS · Power Sinus 3200VA Potência de 3200 VA. |
| Notebook ASUS VivoBook Go 15 | 3 | ASUS · E1504FA-NJ732 AMD Ryzen 5 7520U; 8 GB RAM; SSD de 512 GB; tela Full HD de 15,6 polegadas. |
Especificações técnicas
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| Tablet Samsung Galaxy Tab S10 FE | 1 | Samsung · Galaxy Tab S10 FE 8 GB RAM; 128 GB de armazenamento; tela de 10,9 polegadas; S Pen. |
Especificações técnicas
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| Impressora multifuncional a laser | 2 | HP · Neverstop 1200W Impressão a laser e conexão Wi-Fi. |
| Notebook Acer A515-54G-55HW | 4 | Acer · A515-54G-55HW Intel Core i5; 8 GB RAM; HD de 256 GB. |
| Notebook Acer A515-56-55LD | 2 | Acer · A515-56-55LD Intel Core i5; 8 GB RAM; SSD de 256 GB. |
| Notebook Lenovo IdeaPad | 1 | Lenovo · IdeaPad Intel Core i3; 4 GB RAM; SSD de 256 GB. |
| Roteador TP-Link Archer C80 | 1 | TP-Link · Archer C80 Roteador sem fio Gigabit. |
| Switch HPE Aruba | 1 | HPE Aruba Switch de rede. |
| Mini projetor multimídia | 1 | Projeção multimídia. |
| HD externo Toshiba — 2 TB | 1 | Toshiba Armazenamento externo de 2 TB. |
| HD externo Toshiba — 4 TB | 1 | Toshiba Armazenamento externo de 4 TB. |
| Mesa tipo bancada | 6 | Estação de trabalho para alunos. |
| Cadeira de estação de trabalho | 9 | Assento para estação de trabalho de alunos. |
| Armário de porta dupla | 4 | Armazenamento de materiais do laboratório. |
| Prateleira de madeira | 3 | Organização de materiais do laboratório. |
| Conjunto de mesa e cadeira para o servidor | 1 | Uma mesa e uma cadeira. |
Noturno — servidor de alto desempenho
- Quantidade
- 1
HPE · ML3502 × Intel Xeon Silver 4210R; 128 GB RAM; 4 × 4 TB HDD em RAID 5.
Especificações técnicas
- Memória HPE DDR4-2933, Dual Rank.
- Quatro discos SATA de 4 TB, 7200 RPM, 3,5 polegadas, em RAID 5.
- Placa de vídeo NVIDIA Quadro P1000.
- Duas fontes redundantes de 800 W.
- Rede integrada com duas portas de 10 Gb.
- Leitor DVD-ROM SATA interno.
- Monitor Philips de 27 polegadas, 4K.
Xavier — servidor de alto desempenho
- Quantidade
- 1
UPD SYS-620P-TR2 × Intel Xeon Silver 4310; 256 GB RAM ECC; 2 × 14 TB HDD.
Especificações técnicas
- Dois processadores de 12 núcleos e 24 threads cada, 2,1 GHz, cache de 18 MB e TDP de 120 W.
- Memória ECC DDR4-3200.
- Dois discos SATA de 14 TB.
- Referência DCRE: 2024/10702-2.
Ciclope — Apple iMac
- Quantidade
- 1
Apple · iMac M3Apple M3; 24 GB de memória unificada; SSD de 2 TB.
Especificações técnicas
- CPU de 8 núcleos: 4 de desempenho e 4 de eficiência.
- GPU de 10 núcleos e Neural Engine de 16 núcleos.
- Gigabit Ethernet e duas portas Thunderbolt / USB 4.
Magneto — servidor de alto desempenho
- Quantidade
- 1
2 × Intel Xeon Gold 5520+; 768 GB RAM; 2 × NVIDIA RTX 6000 Ada de 48 GB.
Especificações técnicas
- Dois processadores Intel Xeon Gold 5520+, 28 núcleos, 2,2 GHz.
- Memória DDR5-6400 de 768 GB (12 × 64 GB).
- Armazenamento: HDD de 14 TB e SSD de 5,76 TB.
- Duas GPUs NVIDIA RTX 6000 Ada Generation, cada uma com 48 GB GDDR6 ECC, interface de 384 bits e largura de banda de 960 GB/s.
- Por GPU: 18.176 núcleos CUDA, 568 núcleos Tensor de 4ª geração e 142 núcleos RT de 3ª geração.
- Por GPU: 91,1 TFLOPS FP32, 210,6 TFLOPS em Ray Tracing e 1.457 AI TOPS em Tensor.
- Por GPU: TDP de 300 W, quatro conexões DisplayPort 1.4a, slot duplo PCIe Gen 4 ×16.
Fênix — drone multisensor
- Quantidade
- 1
Spectral 2 Nuvem UAVSensores RGB para mapeamento, multiespectral e termal.
No-break SMS Net4
- Quantidade
- 2
SMS · Net4 1800VAPotência de 1800 VA.
No-break SMS Power Sinus
- Quantidade
- 2
SMS · Power Sinus 3200VAPotência de 3200 VA.
Notebook ASUS VivoBook Go 15
- Quantidade
- 3
ASUS · E1504FA-NJ732AMD Ryzen 5 7520U; 8 GB RAM; SSD de 512 GB; tela Full HD de 15,6 polegadas.
Especificações técnicas
- Windows 11 Pro.
- Cor Mixed Black.
Tablet Samsung Galaxy Tab S10 FE
- Quantidade
- 1
Samsung · Galaxy Tab S10 FE8 GB RAM; 128 GB de armazenamento; tela de 10,9 polegadas; S Pen.
Especificações técnicas
- Processador Exynos 1580, Wi-Fi e Android 15.
Impressora multifuncional a laser
- Quantidade
- 2
HP · Neverstop 1200WImpressão a laser e conexão Wi-Fi.
Notebook Acer A515-54G-55HW
- Quantidade
- 4
Acer · A515-54G-55HWIntel Core i5; 8 GB RAM; HD de 256 GB.
Notebook Acer A515-56-55LD
- Quantidade
- 2
Acer · A515-56-55LDIntel Core i5; 8 GB RAM; SSD de 256 GB.
Notebook Lenovo IdeaPad
- Quantidade
- 1
Lenovo · IdeaPadIntel Core i3; 4 GB RAM; SSD de 256 GB.
Roteador TP-Link Archer C80
- Quantidade
- 1
TP-Link · Archer C80Roteador sem fio Gigabit.
Switch HPE Aruba
- Quantidade
- 1
HPE ArubaSwitch de rede.
Mini projetor multimídia
- Quantidade
- 1
Projeção multimídia.
HD externo Toshiba — 2 TB
- Quantidade
- 1
ToshibaArmazenamento externo de 2 TB.
HD externo Toshiba — 4 TB
- Quantidade
- 1
ToshibaArmazenamento externo de 4 TB.
Mesa tipo bancada
- Quantidade
- 6
Estação de trabalho para alunos.
Cadeira de estação de trabalho
- Quantidade
- 9
Assento para estação de trabalho de alunos.
Armário de porta dupla
- Quantidade
- 4
Armazenamento de materiais do laboratório.
Prateleira de madeira
- Quantidade
- 3
Organização de materiais do laboratório.
Conjunto de mesa e cadeira para o servidor
- Quantidade
- 1
Uma mesa e uma cadeira.
Galeria de fotos
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Localização
Localização institucional do laboratório.
Endereço
Campus Paragominas
Universidade Federal Rural da Amazônia (UFRA)
PA-256, s/n
Paragominas — PACEP 68627-451